Пистолет был разработан в 1893 году братьями Федерле, которые работали на оружейной фабрике у других братьев Маузеров. Еще два года у них ушло на доработку новой модели автоматического пистолета, уже при участие Пауля Маузера. Так как владельцем оружейной фабрики являлся Маузер, конструкция Федерле была запатентовано на имя Пауля Маузера, сначала в Германии (11 сентября 1895 года), а через год в Великобритании (1896 год).
Серийное производство пистолета началось в 1897 году, боевое крещение Маузер получил во время первой англо-бурской войны (1899-1902 гг.) У военных он сразу получил признание и успех. До 1908 года было произведено 70 тысяч пистолетов.
Отличительными конструктивными особенностями Маузера С-96 были регулируемый прицел, затвор, скрытый в ствольной коробке, блочная конструкция УСМ (ударно-спусковой механизм), вынесенная перед спусковой скобой коробка магазина, с откидной крышкой, размещенной «по винтовочному», шахматное размещение патронов. В комплекте с пистолетом шла деревянная кобура, которую можно было использовать, как приклад, превращая Маузер в легкий карабин. Специально для Маузера, на основе патрона 7,65 «Борхардт» был разработан патрон 7,63×25 «Маузер».


В 1900 году у Маузера К-96 появились серьезные конкуренты, пистолет Браунинга и пистолет Люгера «Парабеллум». На их фоне все недостатки Маузера стали отчетливо видны, он был сложен в изготовление, чувствителен к загрязнению, его неудобно было заряжать и размеры пистолета, по сравнению с конкурентами были просто огромны.








Это привело к тому, что на вооружение Маузер был принят лишь частично и то из за нехватки парабеллумов. При этом потребовалось поменять калибр пистолета до 9 мм, подогнав под штатный патрон 9×19 «Парабеллум». Переделанные Маузеры в целях безопасности помечались цифрой девять на рукоятке потому, что при стрельбе 9 мм патроном из пистолетов 7.63 мм происходил разрыв ствола.



В России первые Маузеры появились в 1897 году под названием «Маузер в колодке» или «Маузер № 2». «Маузером № 1» называлась карманная 6,35-мм модель пистолета. В России с 1913 года Маузеры состояли на вооружении у пилотов аэропланов и в автомобильных и мотоциклетных частях.
Наибольшую популярность в России Маузер приобрел после революции, благодаря британской помощи белогвардейским частям большое количество этих пистолетов попало в руки басмачей. В 1922 -1930гг. для ВЧК-ОГПУ и Красной Армии было закуплено большое количество 7,63 мм Маузеров, эти пистолеты были очень популярны у большевиков. На западе они даже получили название «Боло-маузер» (большевистский маузер).



Такое массовое распространение и популярность пистолета даже привело к тому, что в 1928 году 7,63-мм пистолетный патрон «Маузер» стал штатным патроном. Калибр уровняли с «трехлинейным» 7,62 мм, а капсюль был использован от патрона «Наган».
Маузер К-96 подвергался неоднократной модернизации. Модернизированная модель пистолета 1912 года отличалась невероятной «живучестью» и улучшенной баллистикой. Испанский пистолет Астра 900 был разработан на основе схемы К-96. Модели Астра 901-904 получили переводчик режима огня. Автоматические модели Маузер 711 и 712 помимо переводчика получили также, сменные магазины на 10, 20 и 40 патронов. Но пистолеты с переводчиками имели крайне низкие показатели кучности огня, поэтому эти модели Маузеров на вооружение приняты не были. В Китае К-96 получил прозвище «Boxed Cannon», копии пистолета выпускались разного калибра вплоть до 45 (11,43 мм). Как и все китайское копии пистолета имели сильнейший разброс пуль, прицельно стрелять из китайских Маузеров было невозможно ни при каких условиях.


Использовались Маузеры и в ходе Великой Отечественной Войны, и даже в Афганистане, и в Чечне при уничтожении бандформирований русские бойцы находили эти легендарные пистолеты, разработанные век назад.